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Notes techniques
Détermination du rôle de certaines peptidases bactériennes par inférence à partir de données hétérogènes et incomplètes
La détermination du rôle des protéines est à l'origine de la plupart des études biologiques. Elle est encore plus d'actualité depuis l'avènement du séquençage des génomes qui fournit des protéines de rôle inconnu en grande quantité. Le séquençage de nouveaux génomes a permis, par ailleurs, l'obtention de données post-génomiques à haut débit comme les données transcriptomiques. Il a permis également la construction de données comme les profils phylogénétiques.
L'approche utilisée par Liliana Lopez, Véronique Monnet et Alain Trubuil de l’Unité MIAJ du centre INRA de Jouy en Josas, mêlant statistiques et biologie, intègre ces données post-génomiques pour prédire puis valider le rôle de protéines protéolytiques chez Lactococcus lactis.
Caractérisation de la forme active d'une enzyme SOR (Sulfur Oxygenase Reductase)
L'oxydation et la réduction des composés sulfurés sont des processus vitaux pour de nombreux procaryotes, et constituent des étapes essentielles du cycle global du soufre. L'enzyme SOR (Sulfur Oxygenase Reductase) est en particulier responsable de la dismutation du soufre chez les archaea.
L'équipe du Laboratoire de Bioénergétique et Ingénierie des protéines de Marseille (composée de N. Pelletier , G. Leroy ,M.Guiral, M-T.Giudici-Orticoni et
C.Aubert) a décrit pour la première fois la caractérisation d'une enzyme SOR d'origine bactérienne et étudié en détail le rôle de la température dans l'acquisition de la forme active de SORs recombinantes et natives.
Des anticorps polyclonaux de lapin anti-SOR produits par P.A.R.I.S ont été utilisés en western-blot pour détecter la présence des enzymes SORs de A.aeolicus.
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Séparation immunomagnétique des oocystes de toxoplasme
Aurélien Dumètre et Pr. Marie-Laure Dardé (EA 3174, Laboratoire de Parasitologie, Faculté de Médecine de Limoges) sont à l’origine du développement et de l’application en conditions naturelles d’une nouvelle méthode de détection des oocystes dans l’eau, la séparation immunomagnétique (IMS). Cette technique a été développée en utilisant un anticorps monoclonal, 4B6, couplé à la bille paramagnétique BM0829 de P.A.R.I.S. Elle permet de détecter 1 oocyste/L d’eau non turbide et 10 oocystes/L d’eau faiblement turbide (environ 10 NTU).
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